Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms