Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HERVK_113P63121 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms