Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 RPL18P1-201ENST00000497218 552 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC010615.2-201ENST00000596705 566 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 SARS2-211ENST00000598831 665 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC147067.2-201ENST00000608161 289 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC130469.2-201ENST00000625112 1092 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 IFNWP19-201ENST00000438727 566 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC091132.3-201ENST00000579701 470 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC138645.1-201ENST00000582765 470 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 BACH1-AS1-202ENST00000615718 700 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 S100B-202ENST00000367071 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC090095.1-201ENST00000519275 871 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TSACC-203ENST00000368253 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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