Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC135012.1-201ENST00000563931 7430 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KCNMB1-201ENST00000274629 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL713866.1-201ENST00000563320 3125 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms