Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOP2AP11388 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms