Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SCN2BO60939 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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SCN2BO60939 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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SCN2BO60939 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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