Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM185A-210ENST00000613273 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP4-204ENST00000409143 2082 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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