Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLRF2D3W0D1 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms