Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC018766.1-201ENST00000601211 484 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms