Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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