Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms