Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCC8Q09428 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms