Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CNTN2Q02246 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms