Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SSBP2P81877 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms