Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms