Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms