Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MTHFRP42898 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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