Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJB2P29033 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJB2P29033 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJB2P29033 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GJB2P29033 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GJB2P29033 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms