Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms