Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TAF1P21675 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TAF1P21675 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TAF1P21675 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms