Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RIN2-201ENST00000255006 4505 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PIGM-201ENST00000368090 4319 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CYP26B1-202ENST00000412253 4025 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms