Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RLBP1P12271 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RLBP1P12271 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.6 ms