Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PCNAP12004 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PCNAP12004 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCNAP12004 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCNAP12004 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PCNAP12004 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCNAP12004 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCNAP12004 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCNAP12004 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PCNAP12004 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCNAP12004 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCNAP12004 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCNAP12004 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCNAP12004 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCNAP12004 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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