Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms