Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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ERVV-1B6SEH8 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ERVV-1B6SEH8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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ERVV-1B6SEH8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ERVV-1B6SEH8 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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