Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SMG5Q9UPR3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms