Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms