Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PPARGC1AQ9UBK2 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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PPARGC1AQ9UBK2 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PPARGC1AQ9UBK2 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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