Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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CCDC88CQ9P219 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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