Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CALCOCO1Q9P1Z2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms