Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FANCFQ9NPI8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FANCFQ9NPI8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FANCFQ9NPI8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FANCFQ9NPI8 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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FANCFQ9NPI8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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