Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SMIM3Q9BZL3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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