Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms