Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL034417.4-201ENST00000641354 2101 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LINC02473-201ENST00000569621 2195 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms