Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARRDC4Q8NCT1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARRDC4Q8NCT1 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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