Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF2Q8IX21 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF2Q8IX21 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms