Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PDCD1Q15116 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PDCD1Q15116 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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PDCD1Q15116 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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PDCD1Q15116 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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PDCD1Q15116 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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PDCD1Q15116 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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PDCD1Q15116 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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PDCD1Q15116 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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PDCD1Q15116 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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PDCD1Q15116 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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PDCD1Q15116 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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