Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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HERC3Q15034 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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HERC3Q15034 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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HERC3Q15034 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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