Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FMODQ06828 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FMODQ06828 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FMODQ06828 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FMODQ06828 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FMODQ06828 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FMODQ06828 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FMODQ06828 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FMODQ06828 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
FMODQ06828 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
FMODQ06828 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
FMODQ06828 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
FMODQ06828 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms