Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPIBQ01892 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms