Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NR2E1-201ENST00000368983 2612 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LINC02080-201ENST00000585863 3085 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LINC00969-213ENST00000445707 2363 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ZNHIT6-201ENST00000370574 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 GABBR1-201ENST00000355973 3506 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AL162727.1-201ENST00000437712 3043 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 IL10RA-201ENST00000227752 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LINC01141-203ENST00000426428 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SPRY2-202ENST00000377104 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 STAT6-205ENST00000543873 3119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TFIP11-204ENST00000407690 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 CEP63-204ENST00000383229 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 DCK-204ENST00000504952 2614 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CBX1P83916 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX1P83916 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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