Protein–RNA interactions for Protein: P63128

ERVK-9, Endogenous retrovirus group K member 9 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-9P63128 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVK-9P63128 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVK-9P63128 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms