Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOSBP53539 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOSBP53539 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms