Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 GOLGA2-210ENST00000490628 428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 AC004832.1-204ENST00000610737 1018 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 UBR1-212ENST00000627960 189 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NESP48681 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 PPP4R1L-201ENST00000244070 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 C17orf98-201ENST00000614158 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NESP48681 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NESP48681 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 KRT41P-201ENST00000393988 1293 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 AL008719.1-201ENST00000430449 473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 AC136475.6-201ENST00000533113 289 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 AP000439.1-201ENST00000544004 581 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 AC108002.3-201ENST00000612629 503 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NESP48681 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms