Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT9P35527 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT9P35527 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT9P35527 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms