Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXA13P31271 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms