Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms