Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms