Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C4BP0C0L5 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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