Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMNAP02545 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMNAP02545 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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